后来，朝廷恢复新法，停止了十科举士的科考制度，下诏进士不用学诗赋，而专门研究经义，解除了对《字说》的禁锢，并且废除了春秋科目。国子监上奏朝廷以王安石所撰写的《熙宁字说》、《洪范传》及王雱的《论语义》和《孟子义》刊印后分发给学生，学生们的文章又开始以王氏所定为规范，至此，王氏学说重新兴盛起来。
徽宗崇宁期间，朝廷再次倡导新法，蔡京升任宰相，将元祐当人列为奸党，禁止他们传播学术，烧毁了范祖禹、唐鉴和三苏、黄庭坚、秦观等人的文集。言官们纷纷上书说原直秘阁程颐制造邪说，惑乱民心，而尹焯、张绎都是他的党羽。朝廷下诏河南知府驱逐程颐门人，程颐的著作也让相关部门严加封锁。这是宋朝当政者直接程学的开始。朝廷将王安石的雕像放在孔子身边，位置仅次于孟子，并追封为舒王。他的儿子王雱被封为临川伯，在孔庙陪祭。
宣和中期，朝廷再次禁止元祐学术，凡事沿用元祐学术的举人全部被定为违制。有个福建书商印制司马光等人的文集，朝廷知道后，立即下诏将其制版烧毁。苏轼、黄庭坚的所有著作全部被焚毁，而又继续援用苏黄学说的人全部被定罪为“大不恭”。